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トランケーションペプチドライブラリーは、最小限の結合モチーフの同定、構造活性関係の研究、最適化された薬剤の設計、タンパク質間相互作用の調査、タンパク質上のエピトープのマッピングに使用されます。研究者は、タンパク質の重要な機能領域やモチーフを同定することを目的として、アミノ酸を 1 つずつ、またはまとめて削除してタンパク質からペプチド配列を体系的に短縮し、短縮ペプチド ライブラリを生成します。